Di tengah Perang Cawan Suci Kelima, Caster menjalankan rencananya, dimulai dengan penangkapan Pedang Hamba Shirou. Dengan semakin kuatnya penyihir itu, Rin dan Archer memutuskan bahwa dia adalah ancaman yang harus segera diatasi. Namun ketika keseimbangan kekuatan dalam perang mulai bergeser, Tuan dan Hamba mendapati diri mereka berjalan di jalan yang berbeda.
Sementara itu, meski kehilangan Servantnya dan tersandung karena cedera, Shirou mengabaikan peringatan Rin untuk meninggalkan battle royale, dan memaksanya untuk bertarung melawan Caster. Bertekad untuk menunjukkan tekadnya dalam keinginannya untuk bertarung, potensi Shirou untuk menjadi pelindung rakyat diuji.
Di tengah pertumpahan darah dan kekacauan, motivasi masing-masing Tuan dan Hamba perlahan terungkap saat mereka mengorbankan segalanya demi bangkit sebagai pemenang dan merebut Cawan Suci.