Dengan berakhirnya Kejuaraan Interhigh, tim bola basket Seirin memfokuskan kembali upaya mereka, berlatih lebih keras dari sebelumnya untuk mendapatkan kesempatan berpartisipasi dalam Piala Musim Dingin. Tetsuya Kuroko dan Taiga Kagami melihat teman lama kembali ke kehidupan mereka, memberikan tantangan baik di dalam maupun di luar lapangan.
Saat keterampilan baru dikembangkan dan aliansi baru tercipta, musuh dari berbagai tim—raksasa bola basket sekolah menengah seperti Yousen, Shuutoku, dan Touou—menghalangi upaya gigih Seirin untuk mencapai puncak. Semua sekolah ini terbukti menjadi musuh tangguh yang kemampuannya meningkat secara eksponensial, sementara Kuroko berjuang untuk menemukan keseimbangan antara tekadnya untuk bermain sebagai bagian dari tim dan keinginannya untuk menang.
Dengan terbukanya kembali luka lama, tantangan baru yang harus dihadapi di lapangan, dan sekumpulan musuh baru—”Raja Tak Bermahkota”—yang bersumpah untuk mengalahkan calon baru, akankah Seirin mampu mencapai impian mereka untuk mengalahkan Generasi Keajaiban?