Pada tahun 2205, seorang bijak khusus yang dikenal sebagai Saniwa memiliki kemampuan untuk memberikan kehidupan pada benda mati. Pada saat yang sama, kekuatan gelap telah memulai plot untuk melakukan perjalanan kembali ke masa lalu dan mengubah jalannya sejarah—dan satu-satunya yang mampu menghentikan mereka adalah Saniwa dan animasi terkuat mereka: pedang bersejarah Jepang, dalam wujud pemuda tampan. .
Touken Ranbu: Hanamaru dibuka pada kehidupan Yamatonokami Yasusada, uchigatana tercinta Souji Okita, saat ia memulai hari pertamanya di benteng Saniwa. Segera bersatu kembali dengan teman lamanya, Kashuu Kiyomitsu, keduanya terjebak dalam kejenakaan sehari-hari sesama pejuang pedang. Mereka tidak pernah melewatkan kesempatan untuk bersenang-senang, baik melalui pertarungan bola salju liar atau memperkenalkan teman-teman terbaru mereka ke benteng. Tentu saja, ketika pemerintah memanggil, para pedang selalu siap memenuhi misinya melindungi sejarah.
