Fall 2008

Tomoya Okazaki dan Nagisa Furukawa telah lulus SMA, dan bersama-sama, mereka mengalami rollercoaster emosional saat tumbuh dewasa. Karena tidak dapat memutuskan arah masa depannya, Tomoya mempelajari nilai etos kerja yang kuat dan menemukan kekuatan dukungan Nagisa. Melalui dedikasi dan kesatuan tujuan dari pasangan tersebut, mereka berusaha untuk menghadapi masalah pribadi mereka, memperdalam hubungan lama mereka, dan menciptakan ikatan baru.

Waktu juga terus berjalan di Dunia Ilusi. Saat dataran menjadi dingin seiring mendekatnya musim dingin, Gadis Ilusi dan Boneka Sampah dihadapkan pada situasi sulit yang mengungkap tujuan sebenarnya Dunia.

Kementerian Pertahanan Jepang memiliki sebuah kelompok pasukan khusus anti-paranormal disebut Pasukan Pencegah Bencana Supernatural. Mereka merupakan orang-orang yang bertanggung jawab untuk melindungi Jepang dan orang-orangnya dari peristiwa supranatural dan paranormal mahkluk gaib.

Empat tahun telah berlalu sejak pertempuran terakhir antara Celestial Being dan Angkatan PBB. Setelah mendirikan Federasi Sphere Bumi , membentuk sebuah kekuatan pelestarian keamanan independen , hukum terpisah dari Federasi tentara formal untuk lebih menyatukan bangsa dan kehendak manusia. Tetapi kenyataannya adalah penindasan yang tidak manusiawi dari penyalahgunaan kekuasaan , doktrin , dan ideologi atas nama persatuan . Saji Crossroad telah mengikuti jalan untuk menjadi seorang insinyur untuk menjaga janjinya pada Louise Halevy , yang pada gilirannya dipaksa untuk terlibat dalam reformasi pemerintah Federasi dan bergabung sebagai pilot mobile suit selama kesenjangan empat tahun . Sementara itu, Setsuna F. Seiei, setelah selamat dari pertempuran hebat empat tahun lalu, menyaksikan perubahan di dunia karena tindakan dari Celestial Being . Dengan kekalahan Alejandro Corner, ia bermimpi tentang sebuah dunia yang damai tanpa konflik , tetapi di depan matanya sendiri realitas untuk melanjutkan perdamaian , penindasan yang disebabkan oleh musuh. Dia memutuskan sekali lagi untuk bertarung dengan Gundam , kekuatan dengan potensi untuk mengubah dunia.